中心的定位是开展重大水资源问题综合研究的科技平台，参与国家水资源战略问题咨询与决策支持的机构，面向社会开放的高层次“水资源论坛”，与国内外合作交流的窗口。在中心相关主管、依托部门与共建单位的支持下，决定于2007年12月4-5日在北京召开水资源安全综合研究高层论坛暨中国科学院水资源研究中心第一次学术会议。会议宗旨是充分发挥中国科学院水资源研究中心专家委员会的引航作用，汇纳中国科学院水资源研究和国内相关部门学者与对中国水资源问题研究的战略性和前瞻性建议，探讨中国水资源安全问题研究内容、方法、技术手段及战略对策。具体将从水资源基础性研究、交叉性和前瞻性研究三个方面研讨。