功能基因的谱系多样性:宏基因组学新视角
编号:8 访问权限:仅限参会人 更新:2024-04-10 15:31:25 浏览:322次 口头报告

报告开始:2024年04月13日 15:55(Asia/Shanghai)

报告时间:20min

所在会场:[一] 专题一:地质微生物学研究新理论、新技术与新方法 [1] 专题一:地质微生物学研究新理论、新技术与新方法

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摘要
我们开发了REMIRGE流程,从鸟枪法宏基因组测序读数中重建全长功能基因,并充分探索了冷泉沉积物中关键基因的系统发育多样性。结果表明,参与甲烷、硫和氮循环的功能基因的丰度和多样性在非冷泉点和5个冷泉点存在差异。在海马冷泉的CS位点,我们观察到沉积物在厘米尺度上存在功能类群的分异,其中表层可能是微生物物种和功能的储库。此外,我们还发现相关基因的特定基因序列簇之间存在正相关,表明耦合发生在特定功能类群之间。总的来说,REMIRGE揭示了深海冷泉微生物功能群的代谢通路偏好和系统发育多样性,这是常规方法无法检测到的。
关键词
宏基因组,功能基因,功能基因多样性,功能耦合,新方法建立
报告人
邓晔
研究员 中国科学院生态环境研究中心

稿件作者
邓晔 中国科学院生态环境研究中心
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重要日期
  • 会议日期

    04月12日

    2024

    04月14日

    2024

  • 03月28日 2024

    初稿截稿日期

  • 04月14日 2024

    注册截止日期

主办单位
华中农业大学
中国微生物学会地质微生物学专业委员会
承办单位
华中农业大学资源与环境学院
土壤环境与污染修复湖北省重点实验室
农业微生物资源发掘与利用全国重点实验室
中国地质大学(武汉)
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