自噬基因与环境影响因子在类风湿关节炎的相互作用机制
编号:4347
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更新:2024-04-15 10:17:50 浏览:793次
张贴报告
摘要
目的 研究自噬基因(ATG)和环境影响因子在类风湿关节炎(RA)中的影响机制。方法 从GEO数据库和人类自噬数据库中鉴定差异表达自噬相关基因(DE-ATGs)。STRING 11.0和GeneMANIA数据库建立蛋白-环境影响因子网络。ROC曲线分析和DrugBank分析DE-ATGs与环境影响因子在类风湿关节炎的相互作用机制。GraphPad prism 8.2.1和R语言4.3.0用于统计分析。结果 485个DEGs在破骨细胞分化和化学污染物等信号通路富集。11个DE-ATGs通过hsa-mir-155-5p、RUNX1、TP53和SOX2等调控RA滑膜组织的表达,与四氯二苯二氧芑、二氧化硅有较强的环境因子调控关系。ROC曲线分析确定了具有良好敏感性和特异性的基因,如MYC、MAPK8、CDKN1A和TNFSF10,可用于区分某些表型,这可能是RA的新型生物标志物。结论 自噬基因与新型环境影响因子确立为诊断和治疗RA提供了新思路和方法。
稿件作者
陈雪芹
石柱县疾病预防控制中心
巫光琴
璧山区疾病预防控制中心
张荣
石柱县疾病预防控制中心
张杰
石柱县疾病预防控制中心
吴锦钢
重庆交通大学
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