天然气水合物形成的物质来源对揭示其富集成藏机制至关重要。南海北部已钻探证实存在大量高饱和度天然气水合物矿藏，但其成矿烃类气体来源与成因机制仍未被系统阐明，制约着主力气源的判识和未来勘查部署。本文以南海北部琼东南和神狐海域典型的高饱和度水合物矿藏为研究对象，采用气体地球化学、沉积物有机地球化学、地质微生物组学、地震地质综合解释等多学科融合的方法，探讨了其烃类气体的来源和成因机制。结果显示南海北部水合物气体的成因类型具有多元化特点，原生型、次生型微生物气和热解成因煤型气、油型气均有发现，不同水合物矿藏中热解成因气体遭受了不同强度的微生物降解改造作用：神狐W11-17矿藏> 神狐W18-19矿藏>琼东南GMGS5-W08矿藏。水合物气源层由浅部微生物气源层（20-85℃）和深部热解成因气源层（镜质体反射率R_o＞0.5%）组成，目前已钻遇的300mbsf以浅的微生物气源层产气潜力相对较低，但热解成因气源由于具备一定规模的烃源灶和正处于成熟阶段的倾气型煤系烃源岩等条件而表现出较高的产气潜力。深部热解成因烃源灶、中部常规油气藏、浅部微生物气源层和复合型输导通道（控洼断裂、气烟囱、管状渗漏、微裂缝等）构成了南海北部高饱和度水合物矿藏的气源供给体系，深部热解气的贡献极为关键，但大部分热解气运移经过微生物气源层（20-85℃）遭受了微生物次生改造，最后转化为次生型微生物甲烷为水合物成矿供源。南海北部高饱和度水合物矿藏中的烃类气体具有3种成因：一是从深部热解成因烃源灶直接运移而来，即未降解热解气；二是深部来源热解成因烃类运移至微生物气源层后经微生物厌氧降解产甲烷过程生成，即次生型微生物气；三是浅部微生物气源层中的微生物利用原地沉积物有机质直接生成，即原生型微生物气。

气体来源,水合物,成因