摘要：目的 近年来，环境微生物对健康的影响越来越受到重视，不基于培养的健康相关室内微生物组的研究数量也显著增加。这些研究通常对地面及上层空气的灰尘进行真空采集，空气落尘采用降尘采样器采集，但目前较少有研究对不同采样方法采集的灰尘微生物组组分进行比较。因此，健康相关的微生物分类群是否因不同的采样方法而发生变化尚不清楚。 方法 本研究比较了山西大学87间宿舍培养皿内空气落尘与地面及其上表面灰尘的微生物群落组成。通过16 s rRNA基因测序对微生物群落组成进行测定。 结果 高校宿舍空气落尘和地面吸尘的微生物群落组成显著不同（R² = 0.65，P＜0.001）。空气落尘中的优势菌属为青枯菌属Ralstonia（15.6%）、暗单胞菌属Pelomonas（11.3%）、厌氧芽孢杆菌属Anoxybacillus（9.3%）和苍白杆菌属Ochrobactrum（6.2%）；地面吸尘中的优势菌属为假单胞菌属Pseudomonas（75.1%）。因此，本研究观察了空气落尘和地面吸尘中不同的微生物组对鼻炎、呼吸道感染和哮喘的影响。在空气落尘微生物组中分别观察到鼻炎和呼吸道感染相关细菌，而在空气微生物群落和地面微生物群落中均观察到了哮喘相关细菌。本研究利用微生物组搜索引擎（Microbiome Search Engine）对宿舍微生物组进行查询，发现地面和空气灰尘样品的预测来源不同。疾病相关生物信息学分析预测与传染病、心血管疾病和免疫系统疾病相关的标记基因相对丰度不同(P<10^-8)。 结论 总之，不同样品的微生物群落组成可能因不同的采样方法和采样位置有很大差异，并且可能包含不同的健康相关微生物分类群。因此，需要采用各种采样方法进行更多的微生物组与健康的关联研究，以扩展室内微生物组对健康影响的科学研究，并探究室内环境中不同部位的健康相关微生物分类群。