硒蛋白GPX1是脑低级别胶质瘤的预后和化疗相关生物标志物
编号:2882
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更新:2023-04-12 17:11:15 浏览:415次
张贴报告
摘要
目的 谷胱甘肽过氧化物酶1(GPX1)是大多数动物组织中的主要硒蛋白,GPX1的表达与癌变和疾病进展高度相关。弥漫性恶性胶质瘤是中枢神经系统(CNS)原发性侵袭性肿瘤,占肿瘤的30%,占所有脑恶性肿瘤的81%,在美国每年导致60多万人死亡和150万确诊病例。世界卫生组织(WHO)根据组织学特征将胶质瘤分为脑低级别胶质瘤(LGG,Ⅰ/Ⅱ)和脑高级别胶质瘤(HGG,Ⅲ/Ⅳ)。LGG生长速度比HGG慢,占所有原发性脑肿瘤的10~20%,中位生存时间在4.7~9.8年之间,但某些亚型存活时间长达13年。该研究的目的是确定GPX1在各种恶性肿瘤中的预后价值,分析GPX1表达与LGG治疗之间的相关性。
方法 癌症基因组图谱(TCGA)、基因型-组织表达(GTEx)和人类蛋白质图谱(HPA)数据库检测人肿瘤组织和正常组织中GPX1的表达水平。事实上,利用TCGA队列探索了GPX1与肿瘤纯度、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)和DNA错配修复基因(MMR)之间的相关性,分别通过GeneMANIA数据库和基因集富集分析(GSEA)进行功能和富集分析。采用COX回归模型和Kaplan-Meier曲线筛选独立的风险因素和LGG的生存概率。中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库被用来确定GPX1对LGG的总生存率(OS)是否有种族特异性影响。通过Kaplan-Meier曲线确定GPX1和化放疗对LGG临床生存结局的交互影响,构建了乘法相互作用的Logistic回归模型。此外,还通过癌症药物敏感性基因组学(GDSC)数据库探讨了GPX1和LGG治疗方案之间的关系。
结果 GPX1在各种肿瘤中高表达,GPX1过表达与LGG的不良预后显著相关。在单变量和多变量Cox模型中,均发现GPX1是LGG的独立预测因素。列线图显示了较高的预测准确性(C-指数:0.804,95%CI:0.74-0.86)。此外,GPX1与多种癌症的TMB、MSI和MMR显著相关。GPX1参与IL6/JAK/STAT3、炎症反应和细胞凋亡信号通路。此外,非放疗、化疗和GPX1低表达是影响LGG预后较好的重要因素。GPX1作为肿瘤促进剂,对LGG生存影响最差,但GPX1联合放化疗的相乘相互作用可能改善不良的临床结局。GPX1与替莫唑胺(TMZ)的半数抑制浓度(IC50)呈负相关(Spearman = -0.44,P = 4.52×10-26)(表1)。
结论 在LGG患者中,GPX1高表达与较短的总生存率相关。GPX1与放化疗的相乘交互作用表现出有益的临床效果,建议对LGG患者进行化疗,尤其是GPX1高表达患者。此外,GPX1高表达可预测LGG的TMZ敏感性,为化疗提供潜在依据。总的来说,这项研究为GPX1在人类肿瘤中的作用,特别是在LGG中的作用提出了丰富的生物学以及临床意义。
关键词
GPX1,预后,化疗,Logistic回归,IC50
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