硒蛋白在新冠肺炎患者的表达及调控作用
编号:2878
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更新:2023-04-12 17:11:14 浏览:441次
张贴报告
摘要
目的 新型冠状病毒肺炎(COVID-19)是由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染所致,可通过呼吸道飞沫和气溶胶途径传播,人群普遍易感,传播速度较快。硒(Se)是人体所必需的一种微量元素,目前已证实,硒是唯一与病毒感染有一定直接关系的微量元素。硒在体内主要以硒蛋白的形式发挥生物学作用,目前硒蛋白与病毒的关系日益受到重视。国内外相关的指南或专家共识提出,应为新冠病毒感染患者提供足量的每日所需的硒及其他微量元素。另有研究表明,硒蛋白在肿瘤、心血管疾病、骨关节炎、地方病等疾病的发病机制及防治方面起着重要作用。但目前仍鲜有关于硒蛋白在新冠肺炎患者中表达及调控的报道。本研究利用公共数据集GSE177477筛选出有症状新冠肺炎患者和无症状新冠肺炎患者差异表达的硒蛋白,了解其在新型冠状肺炎的表达并探讨其在新型冠状肺炎发生发展中的临床意义。
方法 从GEO数据库中(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/?term=)获取数据集GSE177477(n有症状=11,n无症状=18,n健康对照=18),首先对数据集进行预处理,筛选出差异表达的硒蛋白;采用统计学处理,对数据进行配对样本t检验,检验水准α=0.05。然后进行基因功能(gene ontology,GO)与KEGG(kyoto encycopedia of genes and genomes)信号通路富集分析。再使用Logistic单因素和多因素回归分析有差异表达的硒蛋白对新冠肺炎有症状患者和无症状患者的影响。
结果 将数据进行标准化处理后,各样本基因表达数据均数基本稳定,显示数据质量良好可靠,可进行下一步分析。经t检验,结果显示:与健康对照组相比,有症状新冠肺炎患者中12个硒蛋白的表达发生明显变化,其中GPX1、GPX4、GPX6、DIO2、TXNRD1、SELENOF、SELENOK、SELENOS、SELENOT、SELENOW表达升高,TXNRD2、SELENON表达下降,具有统计学意义(p<0.05);在无症状新冠肺炎中,7个硒蛋白的表达发生明显变化,其中GPX2、SELENOI、SELENOO、SELENOS、SELENOT、SELENOW表达升高,SELP表达下降;SELENOS、SELENOT、SELENOW的表达在有症状和无症状感染者中均表达升高。有症状新冠肺炎患者的差异表达硒蛋白的富集分析显示其主要参与新型冠状病毒肺炎、沙门氏菌感染、化学致癌活性氧等生物学过程;无症状新冠肺炎患者的差异表达硒蛋白主要参与新型冠状病毒肺炎、甲型流感、丙型肝炎等生物学过程。多因素Logistic回归分析提示SELENOF(OR=16.494,95%CI:1.660~163.836)对有症状新冠肺炎感染者具有独立的影响作用,SELENOO(OR=110.530,95%CI:1.863~6555.0)、SELENOS(OR=97.044,95%CI:2.090~4506.540)、SELENOW(OR=38.135,95%CI:1.819~799.365)对无症状新冠肺炎感染者具有独立的影响作用。
结论 新冠肺炎患者的硒蛋白的表达可发生明显改变,表明硒和硒蛋白可能参与了新冠肺炎的发生发展及机体的抗病毒过程,这为新型冠状肺炎的预防和治疗提供新的参考依据。
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