谷胱甘肽过氧化物酶GPXs在肠癌患者的表达及风险预测模型的建立
编号:2877
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更新:2023-04-12 17:11:14 浏览:412次
张贴报告
摘要
目的:结直肠癌是消化系统常见的恶性肿瘤,国际癌症研究机构发布的《全球癌症报告》数据显示,2020年结直肠癌居全球发病率第3位和死亡率第2位。谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPXs)是哺乳动物体内一类重要的含硒酶,目前在人类中已经检测到8种不同的GPX(GPX1~GPX8),在体内具有抗氧化、抑制炎症、抑制细胞凋亡等作用。本研究从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)结直肠癌数据库中下载结直肠癌患者的GPXs基因测序数据,分析和比较GPXs基因在癌组织中的表达情况,采用单因素和多因素COX回归探讨结直肠癌患者总体生存期(overall survival,OS)的影响因素,构建GPXs对结直肠癌患者生存预后的列线图预测模型,为分析结直肠癌患者的OS提供参考依据。
方法:从TCGA数据库下载结直癌患者的GPXs家族基因,经R语言预处理及用SPSS 26.0对基因表达数据进行差异表达分析。Spearman分析肠癌组织中GPXs基因表达与肿瘤突变负荷(TMB)的相关性。单因素和多因素COX回归分析预测影响结直肠癌患者生存预后的基因,基于COX回归的结果使用列线图建立结直肠癌患者预测评分模型。
结果:TCGA数据库中共筛选结肠癌455例、直肠癌165例和820例正常人群。得到GPX1~GPX8 8个GPXs差异基因,其中只有GPX2基因分别在结肠癌和直肠癌、结肠癌和正常人群、直肠癌和正常人群的表达差异具有统计学意义(均P<0.05),GPX1、GPX3、GPX4、GPX5、GPX7、GPX8在结肠癌和正常人群中的表达差异具有统计学意义(均P<0.05),但在直肠癌和正常人群中的表达差异无统计学意义(均P>0.05)。Spearman分析显示GPX2(rs=-0.21,P=4.02×10-6)和GPX7(rs=-0.14,P=0.003)在肠癌中的表达水平与TMB呈负相关。单因素COX回归分析显示与结肠癌OS相关的因素有GPX3(HR=1.22,P=0.012)、GPX4(HR=1.39,P=0.045)、年龄(HR=1.02,P=0.010)、pTNM-分期(HR=1.78,P<0.0001),与直肠癌OS相关的因素有年龄(HR=1.08,P=0.0003)。多因素COX回归显示GPX4(HR=1.96,P=0.024)、年龄(HR=1.02,P=0.042)、pTNM-分期(HR=1.61,P=0.001)为影响结肠癌患者OS的危险因素,GPX7(HR=0.44,P=0.020)、GPX8(HR=3.17,P=0.001)、年龄(HR=1.10,P=0.001)为影响直肠癌患者OS的影响因素。结肠癌、直肠癌的列线图预测模型显示GPX4(P<0.01)和年龄(P<0.05)对结肠癌患者的OS具有良好的预测效果,GPX7(P<0.01)、GPX8(P<0.0001)、年龄(P<0.001)对直肠癌患者的OS具有良好的预测效果,一致性指数(C-index)分别为0.71和0.88,校准曲线显示肠癌预测发生率和实际发生率具有良好的一致性。
结论:GPX2的基因表达可能与结直肠癌患者的预后相关;降低GPX4的基因表达对结肠癌患者的预后起到一定保护作用;提高GPX7或降低GPX8的基因表达会改善结肠癌患者的预后。
稿件作者
郝海亚
新疆医科大学
张荣强
陕西中医药大学
李树林
乌鲁木齐市疾病预防控制中心
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