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基于质谱分析的RNA羟甲基修饰研究

RNA修饰；羟甲基；液相色谱-质谱联用

迄今为止，在RNA分子中发现了150多个转录后修饰[1]。研究表明RNA中的大量动态、可逆的修饰具有多种生物学功能，能够参与真核生物基因表达的调控。最新的研究表明，RNA中的N6-甲基腺嘌呤核苷修饰是动态可逆的，由FTO蛋白酶催化去甲基化，并产生N6-羟甲基腺嘌呤核苷中间产物，该过程与许多人类疾病和细胞发育紧密相关[2]。羟甲基修饰的稳定性不好，且在生物体内含量极低。因此，我们建立了一种新的酶解方法结合液相色谱-质谱联用技术研究哺乳动物细胞RNA中的羟甲基修饰。通过该方法，我们成功地在哺乳动物细胞的RNA中检测并准确定量了3种羟甲基修饰，其中括1种新型修饰： N2-羟甲基鸟嘌呤核苷。